대통령직인수위는 위원장과 부위원장, 기획위원장, 그리고 7개 분과와 1개 위원회, 2개 특별위원회로 구성된다.
우선 인수위원장과 부위원장은 각기 안철수 국민의당 대표와 권영세 국민의힘 의원이 맡아 지휘봉을 잡는다. 인수위 7개 분과는 기획조정, 외교안보, 정무사법행정, 경제1(거시·재정·금융), 경제2(산업), 과학기술교육, 사회복지문화 등이다. 7개 분과 인수위원은 현행법상 위원장과 부위원장 포함해 24명 이내로 이뤄진다.
기획위원회는 인수위가 짠 국정과제에 대선공약이 효과적으로 반영하는 역할을 한다. 윤석열 선대위에서 정책본부장을 맡았던 원희룡 전 제주지사가 위원장을 맡았다. 대통령직인수법에 규정돼있지 않은 조직이라 인수위원이 참여하지 않는다. 공약을 잘 아는 전문가들이 다수 참여할 것으로 보인다.
분과 중 경제1분과는 거시·재정·금융 분야를 담당하고 경제2분과는 산업 정책 전반을 다룬다. 윤 당선인 공약 개발에 참여한 경제 전문가들이 다수 포진할 전망이다.
산하 위원회로는 국민통합위원회가 있다. 윤 당선인이 대선 기간 강조해왔던 지역·세대·계층간 갈등과 분열 극복을 위한 조직이다. 그는 “유능하고 능력 있는 국정운영으로 지역과 계층, 세대를 아우르는 진정한 국민통합을 이루기 위한 것”이라고 설명하며 지역·여성 안배 인사도 없다는 원칙도 밝혔다.
특위는 지역균형발전특위와 코로나비상대응특위 등 두개다. 먼저 지역균형발전특위는 기획위처럼 공약의 국정과제 반영을 위한 기구다. 기획위가 공약 전반을 다룬다면 지역균형발전특위는 지역공약이 실천되도록 하는 게 목적이다. 윤 당선인은 “지역공약이 제대로 실천되도록 신속하게 새 정부 국정과제에 반영시키고 어디에 살든 기회의 불이익을 받지 않도록 살필 것”이라고 설명했다.
코로나비상대응특위는 소상공인 코로나19 손실보상을 비롯한 방역정책을 종합적으로 다룬다. 윤 당선인의 주요 공약 중 하나인 만큼 안철수 인수위원장이 위원장을 겸임토록 해 힘을 실었다.